東大に行けるチャンスがあるならばぜひ行くべきだと思います。
GPAはアメリカの大学院の合否に影響しますが、単純に数字同士を比べるのではなく、どの学校で得たGPAかも考慮されます。(例えばアメリカでは私立大学は公立大学に比べて甘い採点が付く傾向があることを考慮していると、私立と公立の両方を経験した私の指導教官は言っていました。)
東大に入ることが難しいのは有名なので、ぜひそれは活かすべきかと思います。
高校ではいろいろな科目でそこそこ優れていることが評価されると思いますが、大学以降は学術分野に限らず自分のやりたいことで突き抜けていればいいので、高校までの成績で自分の将来の選択肢を狭める必要はないかと思います。
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